Package: blixem (4.44.1+dfsg-7 and others)

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navigatore interattivo di allineamenti di sequenze

Blixem è un navigatore interattivo di allineamenti di sequenze che sono state impilate in un allineamento multiplo "master-slave"; non è un "vero" allineamento multiplo, ma un allineamento "uno-a-molti".

 * sezione panoramica che mostra le posizioni di geni e allineamenti
   intorno alla finestra di allineamento;
 * sezione dettagliata che mostra l'allineamento effettivo di sequenze
   di proteine o nucleotidi alla sequenza di DNA genomico;
 * visualizzazione di allineamenti rispetto ad entrambi i filamenti della
   sequenza di riferimento;
 * visualizzazione di sequenze in modalità nucleotidi o proteina: in
   modalità proteina, Blixem mostrerà la traduzione a 3 frame della
   sequenza di riferimento;
 * i residui sono evidenziati in colori differenti se sono una
   corrispondenza esatta, una sostituzione conservativa o una mancata
   corrispondenza;
 * sono gestiti allineamenti con gap, con inserzioni e delezioni
   evidenziate nella sequenza corrispondente;
 * le corrispondenze possono essere ordinate e filtrate;
 * SNP e altre variazioni possono essere evidenziate nella sequenza di
   riferimento;
 * le code poli(A) possono essere visualizzate e i segnali poli(A)
   evidenziati nella sequenza di riferimento.

Tags: Interface Toolkit: GTK

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Download blixem

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
armel	4.44.1+dfsg-7+b2	1,297.8 kB	2,160.0 kB	[list of files]