Paquet : maqview (0.2.5-11)

Liens pour maqview

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Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [maq.sourceforge.net]

Paquets similaires :

graphical read alignment viewer for short gene sequences

Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.

In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.

Autres paquets associés à maqview

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgl1

bibliothèque de transport GL indépendante du fournisseur – prise en charge de l’ancienne GL
dep: libglu1-mesa

bibliothèque utilitaire Mesa OpenGL (GLU)

ou libglu1

paquet virtuel fourni par libglu1-mesa
dep: libglut3.12 (>= 3.4.0)

boîte à outils d'utilitaires OpenGL
dep: libstdc++6 (>= 5)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger maqview

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	116,6 ko	889,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	110,0 ko	954,0 ko	[liste des fichiers]
armel	99,4 ko	889,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	99,4 ko	825,0 ko	[liste des fichiers]
i386	125,2 ko	897,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	118,0 ko	1 115,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	125,1 ko	1 145,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	109,9 ko	909,0 ko	[liste des fichiers]