toutes les options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Paquet source : libseqlib  ]

Paquet : libseqlib-dev (1.2.0+dfsg-11 et autres)

Liens pour libseqlib-dev

Screenshot

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source libseqlib :

Responsables :

Ressources externes :

Paquets similaires :

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data (dev)

C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.

This package contains the header files and static library.

Étiquettes: Développement de logiciel: Bibliothèques, Rôle: Bibliothèque de programmation

Autres paquets associés à libseqlib-dev

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances

Télécharger libseqlib-dev

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 1.2.0+dfsg-11+b1 216,1 ko1 197,0 ko [liste des fichiers]
arm64 1.2.0+dfsg-11+b1 203,1 ko1 207,0 ko [liste des fichiers]
armel 1.2.0+dfsg-11+b1 204,1 ko1 108,0 ko [liste des fichiers]
armhf 1.2.0+dfsg-11+b1 205,6 ko1 005,0 ko [liste des fichiers]
i386 1.2.0+dfsg-11+b1 228,3 ko1 031,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 1.2.0+dfsg-11+b1 224,8 ko1 431,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 1.2.0+dfsg-11+b1 222,5 ko1 301,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 1.2.0+dfsg-11+b1 661,5 ko6 408,0 ko [liste des fichiers]
s390x 1.2.0+dfsg-11+b1 208,1 ko1 208,0 ko [liste des fichiers]