Paquet : phyx (1.3.1+ds-2 et autres)

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Paquets similaires :

UNIX-style phylogenetic analyses on trees and sequences

phyx provides a convenient, lightweight and inclusive toolkit consisting of programs spanning the wide breadth of programs utilized by researchers performing phylogenomic analyses. Modeled after Unix/GNU/Linux command line tools, individual programs perform a single task and operate on standard I/O streams. A result of this stream-centric approach is that, for most programs, only a single sequence or tree is in memory at any moment. Thus, large datasets can be processed with minimal memory requirements. phyx’s ever-growing complement of programs consists of over 35 programs focused on exploring, manipulating, analyzing and simulating phylogenetic objects (alignments, trees and MCMC logs). As with standard Unix command line tools, these programs can be piped (together with non-phyx tools), allowing the easy construction of efficient analytical pipelines.

Autres paquets associés à phyx

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [non riscv64, sparc64]

bibliothèque simplifiée d'algèbre linéaire en C++

dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.4+dfsg) [sparc64]

dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.7+dfsg) [riscv64]
dep: libblas3 [sparc64]

implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

ou libblas.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [non arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, riscv64, sh4]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: liblapack3 [sparc64]

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

ou liblapack.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libnlopt0 (>= 2.6.1)

nonlinear optimization library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non alpha]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-2) [alpha]
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

Télécharger phyx

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.3.1+ds-2+b1	2 174,1 ko	23 920,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.3.1+ds-2+b1	2 221,7 ko	20 547,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.3.1+ds-2+b1	2 072,8 ko	20 811,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.3.1+ds-2+b1	1 821,2 ko	18 150,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.3.1+ds-2+b1	1 778,4 ko	12 934,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.3.1+ds-2+b1	1 952,2 ko	18 577,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.3.1+ds-2+b1	2 358,6 ko	21 466,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.3.1+ds-2+b1	2 064,4 ko	19 354,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.3.1+ds-2+b1	2 184,3 ko	26 333,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.3.1+ds-2+b1	2 149,0 ko	26 763,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.3.1+ds-2+b1	2 148,8 ko	25 099,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.3.1+ds-2+b1	2 080,8 ko	15 663,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.3.1+ds-2+b1	2 089,5 ko	21 411,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.3.1+ds-2+b1	2 204,1 ko	20 189,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.3.1+ds-2	2 101,7 ko	52 823,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.3.1+ds-2+b1	2 183,2 ko	19 418,0 ko	[liste des fichiers]