Paquet : phyx (0.999+ds-1)

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Paquets similaires :

UNIX-style phylogenetic analyses on trees and sequences

phyx provides a convenient, lightweight and inclusive toolkit consisting of programs spanning the wide breadth of programs utilized by researchers performing phylogenomic analyses. Modeled after Unix/GNU/Linux command line tools, individual programs perform a single task and operate on standard I/O streams. A result of this stream-centric approach is that, for most programs, only a single sequence or tree is in memory at any moment. Thus, large datasets can be processed with minimal memory requirements. phyx’s ever-growing complement of programs consists of over 35 programs focused on exploring, manipulating, analyzing and simulating phylogenetic objects (alignments, trees and MCMC logs). As with standard Unix command line tools, these programs can be piped (together with non-phyx tools), allowing the easy construction of efficient analytical pipelines.

Autres paquets associés à phyx

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libarmadillo9 (>= 1:9.100.5+dfsg)

bibliothèque simplifiée d'algèbre linéaire en C++
dep: libblas3

implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

ou libblas.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base
dep: libc6 (>= 2.23)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64, i386]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: liblapack3

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

ou liblapack.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base
dep: libnlopt-cxx0

nonlinear optimization library (C++ interface)
dep: libnlopt0 (>= 2.2.4)

nonlinear optimization library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger phyx

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 812,5 ko	14 885,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 596,2 ko	13 448,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1 424,4 ko	8 522,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 842,5 ko	15 189,0 ko	[liste des fichiers]