Paquet : pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3 et autres)

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Paquets similaires :

simulateur pour les lectures de séquences de PacBio

Les séquenceurs d’ADN PacBio produisent deux types de lectures caractéristiques : CSS (courtes et taux d’erreur bas) et CLR (longues et taux d’erreur haut), tous deux pouvant être utiles pour les assemblages de novo de génomes. PBSIM simule de telles lectures PacBio à partir d’une séquence de référence en utilisant soit une simulation basée sur un modèle ou basé un échantillonnage. Les lectures simulées sont utiles, par exemple, lors du développement ou l’évaluation d’assembleurs de séquences destinés aux données de PacBio.

Étiquettes: Biologie: Acides nucléiques, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rôle: Programme, But: use::simulating, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à pbsim

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enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, arm64, ia64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [sparc64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,0 ko	121,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,9 ko	100,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	24,5 ko	121,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,5 ko	91,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23,9 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,3 ko	92,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,8 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-2	31,1 ko	128,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,3 ko	103,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,4 ko	122,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,7 ko	120,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	27,1 ko	120,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	25,0 ko	89,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23,6 ko	92,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	29,4 ko	119,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,2 ko	1 081,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,8 ko	91,0 ko	[liste des fichiers]