Paket: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3 und andere)

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Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

simulator for PacBio sequencing reads

PacBio DNA sequencers produce two types of characteristic reads: CCS (short and low error rate) and CLR (long and high error rate), both of which could be useful for de novo assembly of genomes. PBSIM simulates those PacBio reads from a reference sequence by using either a model-based or sampling-based simulation. Simulated reads are useful, for example, when developing or evaluating sequence assemblers targeted at PacBio data.

Markierungen: Biologie: Nukleinsäuren, Feld: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rolle: Programm, Zweck: use::simulating, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu pbsim

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [sparc64]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

pbsim herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,0 kB	121,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,9 kB	100,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,1 kB	120,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,5 kB	91,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23,9 kB	83,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,3 kB	92,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,8 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-2	31,1 kB	128,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,3 kB	103,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,4 kB	122,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,7 kB	120,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	27,1 kB	120,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	25,0 kB	89,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23,6 kB	92,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	29,4 kB	119,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,2 kB	1.081,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,8 kB	91,0 kB	[Liste der Dateien]