toutes les options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Paquet source : libseqlib  ]

Paquet : libseqlib2 (1.2.0+dfsg-11 et autres)

Liens pour libseqlib2

Screenshot

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source libseqlib :

Responsables :

Ressources externes :

Paquets similaires :

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.

Autres paquets associés à libseqlib2

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances

Télécharger libseqlib2

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha (portage non officiel) 1.2.0+dfsg-11+b1 148,5 ko538,0 ko [liste des fichiers]
amd64 1.2.0+dfsg-11+b1 167,7 ko569,0 ko [liste des fichiers]
arm64 1.2.0+dfsg-11+b1 140,9 ko468,0 ko [liste des fichiers]
armel 1.2.0+dfsg-11+b1 132,9 ko431,0 ko [liste des fichiers]
armhf 1.2.0+dfsg-11+b1 135,8 ko335,0 ko [liste des fichiers]
i386 1.2.0+dfsg-11+b1 174,9 ko511,0 ko [liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel) 1.2.0+dfsg-11+b1 192,3 ko885,0 ko [liste des fichiers]
m68k (portage non officiel) 1.2.0+dfsg-11+b1 152,1 ko475,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 1.2.0+dfsg-11+b1 140,6 ko558,0 ko [liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel) 1.2.0+dfsg-11+b1 164,4 ko661,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 1.2.0+dfsg-11+b1 165,1 ko597,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 1.2.0+dfsg-11+b1 155,1 ko404,0 ko [liste des fichiers]
s390x 1.2.0+dfsg-11+b1 154,8 ko512,0 ko [liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel) 1.2.0+dfsg-11+b1 177,9 ko470,0 ko [liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel) 1.2.0+dfsg-11+b1 129,8 ko1 061,0 ko [liste des fichiers]
x32 (portage non officiel) 1.2.0+dfsg-11+b1 162,8 ko471,0 ko [liste des fichiers]