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[ Paquet source : bifrost ]
Paquet : libbifrost0 (1.3.1-1)
Liens pour libbifrost0
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bifrost :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs
Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.
* Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph * No need to build the uncompacted de Bruijn graph * Reads or assembled genomes as input * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary * Graph cleaning: short tip clipping, etc. * Multi-threaded * No parameters to estimate with other tools * Exact or approximate k-mer search of queries
Autres paquets associés à libbifrost0
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- dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger libbifrost0
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| alpha (portage non officiel) | 388,7 ko | 1 526,0 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 417,9 ko | 1 436,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 369,5 ko | 1 324,0 ko | [liste des fichiers] |
| ia64 (portage non officiel) | 509,9 ko | 2 582,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 350,8 ko | 1 504,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64 (portage non officiel) | 428,4 ko | 1 773,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 435,0 ko | 1 644,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 424,2 ko | 1 128,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 430,1 ko | 1 524,0 ko | [liste des fichiers] |
| sparc64 (portage non officiel) | 354,0 ko | 2 125,0 ko | [liste des fichiers] |