Paquet : sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1 et autres)
Liens pour sra-toolkit
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source sra-sdk :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
utilities for the NCBI Sequence Read Archive
Tools for reading the SRA archive, generally by converting individual runs into some commonly used format such as fastq.
The textual dumpers "sra-dump" and "vdb-dump" are provided in this release as an aid in visual inspection. It is likely that their actual output formatting will be changed in the near future to a stricter, more formalized representation[s]. PLEASE DO NOT RELY UPON THE OUTPUT FORMAT SEEN IN THIS RELEASE.
The "help" information will be improved in near future releases, and the tool options will become standardized across the set. More documentation will also be provided documentation on the NCBI web site.
Tool options may change in the next release. Version 1 tool options will remain supported wherever possible in order to preserve operation of any existing scripts.
Autres paquets associés à sra-toolkit
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- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6 (>= 2.14)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libfuse2 (>= 2.6)
- système de fichiers en espace utilisateur - bibliothèque
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- dep: libhdf5-103
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - runtime files - serial version
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- dep: libkdf5-2
- hdf5 access to data in the INSDC Sequence Read Archives
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- dep: libmagic1 (>= 5.12)
- reconnaissance du type de données d'un fichier à l'aide des nombres «⋅magiques⋅» –⋅bibliothèque
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- dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
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- dep: libmbedtls12 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
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- dep: libmbedx509-0 (>= 2.0)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
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- dep: libncbi-vdb2
- libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives
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- dep: libncbi-wvdb2
- virtual layer update modul of ncbi-vdb library
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: libsz2
- bibliothèque de codage entropique adaptatif — SZIP
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- dep: libxml2 (>= 2.6.27)
- Bibliothèque XML GNOME
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: med-config (>= 2.1)
- paquet de configuration générale de Debian Med
Télécharger sra-toolkit
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.9.3+dfsg-1+b1 | 4 816,5 ko | 9 306,0 ko | [liste des fichiers] |