Package: sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1 and others)
Links for sra-toolkit
Debian Resources:
Download Source Package sra-sdk:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Redskaber for NCBI Sequence Read Archive
Værktøjer til at læse SRA-arkivet, generelt ved at konvertere individuelle kørsler til et ofte anvendt format såsom fastq.
De tekstmæssige dumpere »sra-dump« og »vdb-dump« tilbydes i denne udgivelse som en hjælp til visuel inspektion. Det er sandsynligt, at den faktiske uddataformatering vil blive ændret i den nære fremtid for en mere stringent, mere formaliseret repræsentation. AFHÆNG IKKE AF UDDATAFORMATET I DENNE UDGIVELSE.
Informationen »Help« vil blive forbedret i fremtidige udgivelser og værktøjsindstillingerne vil blive standardiseret på tværs af sættet. Yderligere dokumentation vil også blive lagt på NCBI-hjemmesiden.
Værktøjsindstillinger kan ændre sig i den næste udgivelse. Version 1- værktøjsindstillinger vil forblive understøttet hvor muligt for at bevare funktionaliteten på eksisterende skripter.
Other Packages Related to sra-toolkit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
-
- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libfuse2 (>= 2.6)
- Filsystem i brugerrum (bibliotek)
-
- dep: libhdf5-103
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - kørselstidsfiler - seriel version
-
- dep: libkdf5-2
- hdf5 access to data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libmagic1 (>= 5.12)
- Bestem typen af data i en fil via brug af »magiske« tal - bibliotek
-
- dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)
- Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - crypto-bibliotek
-
- dep: libmbedtls12 (>= 2.13)
- Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - tls-bibliotek
-
- dep: libmbedx509-0 (>= 2.0)
- Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - x509-certifikatbibliotek
-
- dep: libncbi-vdb2
- libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libncbi-wvdb2
- virtual layer update modul of ncbi-vdb library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libsz2
- Adaptive Entropy Coding library - SZIP
-
- dep: libxml2 (>= 2.6.27)
- XML-bibliotek til GNOME
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- rec: med-config (>= 2.1)
- Debian Med - generel konfigurationspakke
Download sra-toolkit
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.9.3+dfsg-1+b1 | 4,816.5 kB | 9,306.0 kB | [list of files] |