Paquet : maqview (0.2.5-9)
Liens pour maqview
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source maqview :
Responsables :
- Debian-Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Charles Plessy (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [maq.sourceforge.net]
Paquets similaires :
graphical read alignment viewer for short gene sequences
Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.
In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.
Autres paquets associés à maqview
|
|
|
|
-
- dep: freeglut3
- boîte à outils d'utilitaires OpenGL
-
- dep: libc6 (>= 2.15) [non arm64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
-
- dep: libgl1
- bibliothèque de transport GL indépendante du fournisseur – prise en charge de l’ancienne GL
-
- dep: libglu1-mesa
- bibliothèque utilitaire Mesa OpenGL (GLU)
- ou libglu1
- paquet virtuel fourni par libglu1-mesa
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: libx11-6
- Bibliothèque X11 partie client
-
- dep: libxi6
- bibliothèque d'extension Input X11
Télécharger maqview
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 110,8 ko | 630,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 104,9 ko | 590,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 95,1 ko | 398,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 119,9 ko | 645,0 ko | [liste des fichiers] |