Paquet : apbs (1.4-1 et autres)

Solveur adaptatif de Poisson Boltzmann

APBS est un paquet pour la résolution numérique de l'équation de Poisson-Boltzmann (PBE), un des modèles continus les plus populaires décrivant les interactions entre solutés moléculaires en milieu salinaqueux. Le continuum électrostatique joue un rôle important dans plusieurs domaines de la simulation biomoléculaire, incluant :

 - la simulation des processus de diffusion pour déterminer les cinétiques
    de liaison ligand-protéine et protéine-protéine ;
 - la dynamique moléculaire de solvatation des biomolécules ;
 - le calcul de l'énergie de solvatation et de liaison pour déterminer
    les constantes d'équilibre de liaison ligand-protéine et
    protéine-protéine afin d'aider à la conception rationelle de
    médicaments ;
 - les études de biomoléculaires de titration.

APBS est conçu pour évaluer efficacement les propriétés électrostatiques pour de telles simulations dans un spectre large d'échelle de longueur pour permettre l'étude de molécules de dix à des millions d'atomes.

Étiquettes: Domaine: Chimie, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Champ d'application: Utilitaire

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