Paquet : ampliconnoise (1.29-9)

Liens pour ampliconnoise

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source ampliconnoise :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

suppression du bruit pour les amplicons PCR séquencés 454

AmpliconNoise est un ensemble d'applications pour nettoyer les données de séquences haute fréquence. Il est constitué de trois parties principales :

 - Pyronnoise : rassemble les mauvais points en se basant sur un
    diagramme de flux ;
 - SeqNoise : enlève les mutations de point PCR ;
 - Perseus : enlève les chimères PCR sans avoir besoin d'un ensemble de
    séquences de références.

Étiquettes: Rôle: Programme

Autres paquets associés à ampliconnoise

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgsl25 (>= 2.6)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: mafft

programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

rec: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

Télécharger ampliconnoise

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 080,6 ko	2 036,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 073,3 ko	1 960,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1 065,4 ko	1 955,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1 061,2 ko	1 819,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 078,5 ko	2 011,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1 073,7 ko	2 022,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1 070,4 ko	1 973,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1 093,8 ko	2 592,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1 073,6 ko	2 012,0 ko	[liste des fichiers]