Paketti: anfo (0.98-9) [debports]
Links for anfo
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti :
Ei löytynytYlläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [bioinf.eva.mpg.de]
Samankaltaisia paketteja:
Short Read Aligner/Mapper from MPG
Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).
Muut pakettiin anfo liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libanfo0 (>= 0.98)
- Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libelk0
- implementation of Scheme (the Extension Language Kit)
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libpopt0 (>= 1.14)
- kirjasto komentoriviparametrien jäsentämiseen
-
- dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4)
- protocol buffers C++ library
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi anfo
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
m68k (epävirallinen siirros) | 113.7 kt | 405.0 kt | [tiedostoluettelo] |