[ Source: sniffles ]
Paketti: sniffles (1.0.11+ds-1)
Links for sniffles
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti sniffles:
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [fritzsedlazeck.github.io]
Samankaltaisia paketteja:
structural variation caller using third-generation sequencing
Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.
Muut pakettiin sniffles liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libbamtools2.5.1
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [ei armhf]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- sug: bwa
- Burrows-Wheeler Aligner
Imuroi sniffles
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 186.2 kt | 621.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 167.5 kt | 529.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 166.5 kt | 376.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 200.6 kt | 652.0 kt | [tiedostoluettelo] |