Paketti: ggd-utils (0.0.7+ds-3 ja muut)

Links for ggd-utils

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti ggd-utils:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Muut pakettiin ggd-utils liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

dep: libc6 (>= 2.4) [ei arm64, i386, ppc64el]

Imuroi ggd-utils

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.0.7+ds-3+b6	1,685.4 kt	5,273.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.0.7+ds-3+b6	1,441.3 kt	4,860.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.0.7+ds-3+b6	1,470.3 kt	4,508.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.0.7+ds-3+b6	1,465.2 kt	4,444.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.0.7+ds-3+b6	1,601.7 kt	4,482.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.0.7+ds-3+b6	1,362.7 kt	5,335.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	0.0.7+ds-3+b6	1,385.8 kt	4,987.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.0.7+ds-3+b6	1,415.6 kt	4,924.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.0.7+ds-3+b6	1,545.2 kt	5,183.0 kt	[tiedostoluettelo]