Paketti: covtobed (1.2.0+dfsg-1)

Links for covtobed

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti covtobed:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Muut pakettiin covtobed liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bamtools

toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: zlib1g

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi covtobed

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	44.8 kt	137.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	39.7 kt	121.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	40.3 kt	120.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	41.8 kt	92.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	48.5 kt	144.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	43.4 kt	155.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	43.8 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	45.5 kt	209.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	40.7 kt	133.0 kt	[tiedostoluettelo]