パッケージ: covtobed (1.2.0+dfsg-1)

covtobed に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

その他の covtobed 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: bamtools

BAM（ゲノムアラインメント）ファイルの操作用ツール
dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: zlib1g

圧縮ライブラリ - ランタイム

covtobed のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	44.8 kB	137.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	39.7 kB	121.0 kB	[ファイル一覧]
armel	40.3 kB	120.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	41.8 kB	92.0 kB	[ファイル一覧]
i386	48.5 kB	144.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	43.4 kB	155.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	43.8 kB	149.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	45.5 kB	209.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	40.7 kB	133.0 kB	[ファイル一覧]