Package: last-align (1179-1 and others)
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Debian Resources:
Download Source Package last-align:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Nilesh Patra (QA Page)
External Resources:
- Homepage [last.cbrc.jp]
Similar packages:
comparación de secuencias biológicas de escala de genoma
LAST es un software para la comparación y el alineamiento de secuencias, generalmente ADN o secuencias de proteínas. LAST es similar a BLAST, pero trata mejor con cantidades muy grandes de secuencias de datos. Estas son dos cosas en las que LAST es bueno:
* Comparación de genomas grandes (ej. mamíferos). * Asignación de lotes de etiquetas de secuencia en un genoma.
La principal innovación técnica es que LAST encuentra coincidencias iniciales basadas en su multiplicidad en lugar de usar un tamaño fijo (p. ej. LAST usa 10-meros). Esto le permite asignar etiquetas a genomas sin repetir una máscara y sin verse inundado de resultados repetitivos. Para encontrar estas coincidencias de tamaño variable usa un arreglo de sufijos (inspirado en Vmatch). Con el objeto de lograr una alta sensibilidad usa un arreglo de sufijos no contiguos, de manera análoga al espaciado de semillas.
Other Packages Related to last-align
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteca de ayuda de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 6)
- biblioteca estándar de C++ de GNU v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Biblioteca de compresión, ejecutables
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- rec: parallel
- build and execute command lines from standard input in parallel
-
- rec: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- rec: python3-pil
- Python Imaging Library (Python3)
Download last-align
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| arm64 | 1179-1+b1 | 751.8 kB | 3,742.0 kB | [list of files] |