Paket: ltrsift (1.0.2-10)

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Externe Ressourcen:

Homepage [www.zbh.uni-hamburg.de]

Nachbearbeitung und Klassifikation von LTR-Retrotransposonen

LTRsift ist ein grafisches Werkzeug für die halbautomatische Nachbearbeitung von de-novo vorhergesagten Annotationen von LTR-Retrotransposonen, etwa bei den von LTRharvest und LTRdigest erstellten. Die benutzerfreundliche Oberfläche zeigt LTR-Retrotransposon-Kandidaten, deren mutmaßliche Familien und deren interne Struktur auf hierarchische Art an. Dadurch wird es dem Benutzer ermöglicht die teilweise großen Resultate der de-novo-Vorhersage-Software zu »durchsieben« (sift). Funktionen für anpassbares Filtern und Klassifizieren sind ebenso verfügbar.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Benutzer-Schnittstellen: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zweck: Hilfswerkzeug, GUI-Baukasten: GTK, Zweck: use::analysing, use::browsing, Vergleichen, Daten-Organisation, use::viewing, x11::application

Andere Pakete mit Bezug zu ltrsift

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

2D-Vektorgrafikbibliothek Cairo
dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

Bibliothek GDK-PixBuf
dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

Vielseitige Bibliothek für Genomanalysen
dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)

GLib - Bibliothek von C-Routinen
dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

GTK - Bibliothek für grafische Benutzeroberflächen - alte Version
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes

rec: last-align

Vergleich biologischer Sequenzen für Genome
rec: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools

ltrsift herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	92,6 kB	468,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	96,6 kB	364,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	88,7 kB	464,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	87,6 kB	326,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	87,5 kB	278,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	91,3 kB	337,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	106,3 kB	410,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	109,0 kB	561,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	87,5 kB	334,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	83,3 kB	479,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	98,5 kB	528,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	98,0 kB	464,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	95,9 kB	316,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	90,7 kB	364,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	106,9 kB	400,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	97,8 kB	346,0 kB	[Liste der Dateien]