Paket: clustalw (2.1+lgpl-7 und andere)

Links für clustalw

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket clustalw herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Steffen Moeller (QS-Seite)
Charles Plessy (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [www.clustal.org]

Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen

Clustal W führt ein Alignment mehrerer Nukleotid- oder Aminosäurensequenzen aus. Das Programm erkennt das Format der Eingabesequenzen und ob die Sequenzen aus Nuklein- (DNA/RNA) oder Aminosäuren (Proteine) bestehen. Das Ausgabeformat kann aus verschiedenen Formaten für multiple Alignments ausgewählt werden, etwa Phylip oder FASTA. Clustal W ist allgemein anerkannt.

Die Ausgabe von Clustal W kann händisch editiert werden, jedoch wird ein Alignment-Editor wie SeaView oder Clustal X empfohlen. Bei der Erstellung eines Modells aus Ihrem Alignment, kann die Ausgabe für verbesserte Datenbanksuchen verwendet werden. Das Debian-Paket hmmer erstellt dies mittels eines Hidden-Markov-Modells (HMM).

Markierungen: Biologie: Clustal/ALN, Proteine, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Benutzer-Schnittstellen: Text-basiert interaktiv, Rolle: role::program, scope::utility, Zweck: Vergleichen, Unterstützt Formate: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Andere Pakete mit Bezug zu clustalw

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.29) [nicht alpha, ia64, riscv64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nicht riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

sug: clustalx

Multiples Alignment von Nukleotid- und Proteinsequenzen (grafische Oberfläche)
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

enh: bioperl-run

BioPerl-Hüllen: Skripte
enh: emboss

Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

clustalw herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	276,6 kB	920,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.1+lgpl-7	275,1 kB	787,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.1+lgpl-7	241,9 kB	710,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	259,6 kB	737,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	344,9 kB	1.516,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	264,7 kB	790,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.1+lgpl-7	259,1 kB	941,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	276,1 kB	982,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.1+lgpl-7	276,5 kB	918,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.1+lgpl-7+b1	274,2 kB	622,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.1+lgpl-7	247,5 kB	794,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	314,8 kB	714,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	231,2 kB	747,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.1+lgpl-7	275,3 kB	750,0 kB	[Liste der Dateien]