Paket: clustalw (2.1+lgpl-6)

Links für clustalw

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket clustalw herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Steffen Moeller (QS-Seite)
Charles Plessy (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [www.clustal.org]

Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen

Clustal W führt ein Alignment mehrerer Nukleotid- oder Aminosäurensequenzen aus. Das Programm erkennt das Format der Eingabesequenzen und ob die Sequenzen aus Nuklein- (DNA/RNA) oder Aminosäuren (Proteine) bestehen. Das Ausgabeformat kann aus verschiedenen Formaten für multiple Alignments ausgewählt werden, etwa Phylip oder FASTA. Clustal W ist allgemein anerkannt.

Die Ausgabe von Clustal W kann händisch editiert werden, jedoch wird ein Alignment-Editor wie SeaView oder Clustal X empfohlen. Bei der Erstellung eines Modells aus Ihrem Alignment, kann die Ausgabe für verbesserte Datenbanksuchen verwendet werden. Das Debian-Paket hmmer erstellt dies mittels eines Hidden-Markov-Modells (HMM).

Markierungen: Biologie: Clustal/ALN, Proteine, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Benutzer-Schnittstellen: Text-basiert interaktiv, Rolle: role::program, scope::utility, Zweck: Vergleichen, Unterstützt Formate: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Andere Pakete mit Bezug zu clustalw

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nicht armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

sug: clustalx

Multiples Alignment von Nukleotid- und Proteinsequenzen (grafische Oberfläche)
sug: seaview

Schnittstelle mehrerer Plattformen für Sequenzalignments und Phylogenie

enh: bioperl-run

BioPerl-Hüllen: Skripte
enh: emboss

Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

clustalw herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	275,2 kB	775,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	250,4 kB	722,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	243,1 kB	522,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	294,1 kB	834,0 kB	[Liste der Dateien]