[ Quellcode: ampliconnoise ]
Paket: ampliconnoise (1.29-11)
Links für ampliconnoise
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket ampliconnoise herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Tim Booth (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Pranav Ballaney (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons
AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:
Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences
Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.
Andere Pakete mit Bezug zu ampliconnoise
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- dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgsl27 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket
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- dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]
- GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket für Lineare Algebra
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
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- dep: mafft
- Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
-
- rec: openmpi-bin
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Programmdateien
ampliconnoise herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 1.073,8 kB | 2.525,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 1.086,3 kB | 2.037,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 1.075,1 kB | 2.397,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 1.066,5 kB | 1.956,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 1.061,5 kB | 1.824,0 kB | [Liste der Dateien] |
| hppa (inoffizielle Portierung) | 1.062,8 kB | 1.925,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 1.077,3 kB | 2.000,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 (inoffizielle Portierung) | 1.096,8 kB | 2.314,0 kB | [Liste der Dateien] |
| m68k (inoffizielle Portierung) | 1.060,0 kB | 1.928,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 1.072,6 kB | 2.419,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64 (inoffizielle Portierung) | 1.089,0 kB | 2.589,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 1.094,5 kB | 2.589,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 1.082,4 kB | 1.905,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 1.098,1 kB | 2.085,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sh4 (inoffizielle Portierung) | 1.094,3 kB | 2.384,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc64 (inoffizielle Portierung) | 1.065,6 kB | 14.888,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 1.083,2 kB | 1.992,0 kB | [Liste der Dateien] |