[ buster ]
[ Quellcode: cyvcf2 ]
Paket: python-cyvcf2 (0.10.4-1)
Links für python-cyvcf2
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket cyvcf2 herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Liubov Chuprikova (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
VCF parser based on htslib (Python 2)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 2.
Andere Pakete mit Bezug zu python-cyvcf2
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- dep: libbz2-1.0
- Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]
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- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)
- Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)
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- dep: libhts2 (>= 1.2.1)
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)
- Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat
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- dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)
- Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken
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- dep: python
- Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)
- dep: python (<< 2.8)
- dep: python (>= 2.7~)
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- dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)
- Numerical Python fügt der Sprache Python eine schnelle Array-Einrichtung hinzu
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- dep: python-numpy-abi9
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch python-numpy
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
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- sug: python-cyvcf2-doc
- Paket nicht verfügbar
python-cyvcf2 herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| amd64 | 779,2 kB | 4.566,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 734,6 kB | 4.524,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 755,7 kB | 4.310,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 753,9 kB | 4.575,0 kB | [Liste der Dateien] |