Пакет: python-cyvcf2 (0.10.4-1)

Връзки за python-cyvcf2

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник cyvcf2.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

VCF parser based on htslib (Python 2)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 2.

Други пакети, свързани с python-cyvcf2

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]
dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)
dep: libhts2 (>= 1.2.1)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

XZ-format compression library
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

Secure Sockets Layer toolkit - shared libraries
dep: python

interactive high-level object-oriented language (Python2 version)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

Numerical Python adds a fast array facility to the Python language
dep: python-numpy-abi9

виртуален пакет, предлаган от python-numpy
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

sug: python-cyvcf2-doc

Пакетът не е наличен

Изтегляне на python-cyvcf2

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	779,2 кБ	4 566,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	734,6 кБ	4 524,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	755,7 кБ	4 310,0 кБ	[списък на файловете]
i386	753,9 кБ	4 575,0 кБ	[списък на файловете]