Paket: python-biopython (1.73+dfsg-1)

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [biopython.org]

Python-Bibliothek für die Bioinformatik (implementiert in Python 2)

Das Projekt Biopython ist eine internationale Vereinigung von Entwicklern frei verfügbarer Python-Werkzeuge für rechnergestützte Molekularbiologie.

Es ist eine verteilte, gemeinsame Anstrengung zur Entwicklung von Python-Bibliotheken und -Applikationen, die auf die Anforderungen der aktuellen und zukünftigen Arbeit in der Bioinformatik zugeschnitten sind. Der Quelltext ist unter der »Biopython License« verfügbar, welche sehr liberal ist und kompatibel mit fast jeder Lizenz. Das Projekt arbeitet gemeinsam mit der Open Bioinformatics Foundation, die für das Projekt Speicherplatz für CVS und für die Webseiten bereitstellt.

Dieses Paket ist für die Python-Version 2 zuständig.

Markierungen: Software-Entwicklung: Python-Entwicklung, Bibliotheken, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: Python, Rolle: role::devel-lib, role::shared-lib

Andere Pakete mit Bezug zu python-biopython

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
dep: python

Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

Numerical Python fügt der Sprache Python eine schnelle Array-Einrichtung hinzu
dep: python-numpy-abi9

virtuelles Paket, bereitgestellt durch python-numpy
dep: python-reportlab

Python-Bibliothek zur Erzeugung von PDF-Dokumenten

rec: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools
rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

Dokumentation für die Biopython-Bibliothek

sug: bwa [amd64]

Burrows-Wheeler Aligner
sug: clustalo

Universalprogramm für multiple Sequenzalignments (MSA) von Proteinen
sug: clustalw

Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen
sug: dialign

Segmentbasiertes multiples Sequenzalignment
sug: dssp

Sekundärstruktur-Zuordnung bei Proteinen, basierend auf 3D-Struktur
sug: emboss

Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie
sug: fasttree

phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
sug: mafft

Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
sug: muscle

Programm zur Ausrichtung mehrerer Proteinsequenzen
sug: phylip

package of programs for inferring phylogenies
sug: phyml

Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
sug: prank

Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
sug: probcons

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment
sug: python-matplotlib

Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen
sug: python-mysqldb

Python-Schnittstelle zu MySQL
sug: python-pil

Python-Bildbearbeitungsbibliothek (Pillow-Fork)
sug: python-psycopg2

Python-Modul für PostgreSQL
sug: python-rdflib (>= 4)

Python-RDF-Bibliothek für Speicherung, Auswertung und Serialisierung
sug: python-renderpm

Python-Schnittstelle für Low Level Rendering
sug: python-scipy

wissenschaftliche Werkzeuge für Python
sug: python-tk

Tkinter - Schreiben von Tk-Anwendungen mit Python2
sug: raxml

Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
sug: t-coffee

Multiple Sequence Alignment
sug: w3-dtd-mathml

Mathematical Markup Language V2.0 DTD
sug: wise (>= 2.4.1-16)

Vergleich biologischer Polymere, wie DNA- und Protein-Sequenzen

python-biopython herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.302,5 kB	8.974,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.291,9 kB	8.907,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.282,2 kB	8.822,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.302,6 kB	8.967,0 kB	[Liste der Dateien]