Paket: ray (2.3.1-7)

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [denovoassembler.sourceforge.net]

De-novo-Genomassemblierung von »Next Generation Sequencing«-Daten

Ray ist eine Parallelsoftware zur Berechnung von De-novo-Genomassemblierungen mithilfe von durch Next Generation Sequencing gewonnenen Daten. Die Software ist in C++ geschrieben und kann parallel auf mehreren miteinander verbundenen Computern laufen. Sie nutzt den MPI-Standard (message-passing interface).

Ray beinhaltet:

 - Ray        De-novo-Assemblierung einzelner Genome
 - Ray Méta   De-novo-Assemblierung von Metagenomen
 - Ray Communities  Mikrobenfülle + taxonomisches Profiling
 - Ray Ontologies   Gen-Ontologie-Profiling

Andere Pakete mit Bezug zu ray

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

Paket nicht verfügbar

dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [amd64, mips64el]

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386, mipsel]
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.2)

Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: mpi-default-bin

Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

ray herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	829,1 kB	2.326,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	759,5 kB	2.146,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	718,3 kB	1.949,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	741,7 kB	1.557,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	896,3 kB	2.525,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	787,8 kB	3.543,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	801,6 kB	2.961,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	821,8 kB	2.674,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	767,6 kB	2.378,0 kB	[Liste der Dateien]