Paket: ray (2.3.1-8 und andere)

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [denovoassembler.sourceforge.net]

De-novo-Genomassemblierung von »Next Generation Sequencing«-Daten

Ray ist eine Parallelsoftware zur Berechnung von De-novo-Genomassemblierungen mithilfe von durch Next Generation Sequencing gewonnenen Daten. Die Software ist in C++ geschrieben und kann parallel auf mehreren miteinander verbundenen Computern laufen. Sie nutzt den MPI-Standard (message-passing interface).

Ray beinhaltet:

 - Ray        De-novo-Assemblierung einzelner Genome
 - Ray Méta   De-novo-Assemblierung von Metagenomen
 - Ray Communities  Mikrobenfülle + taxonomisches Profiling
 - Ray Ontologies   Gen-Ontologie-Profiling

Andere Pakete mit Bezug zu ray

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x, x32]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
dep: mpi-default-bin

Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

ray herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	794,1 kB	2.743,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.3.1-8+b1	852,3 kB	2.446,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.3.1-8+b1	788,0 kB	2.418,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.3.1-8+b1	737,1 kB	2.121,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.3.1-8+b1	758,1 kB	1.657,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	830,1 kB	2.572,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.3.1-8+b1	917,3 kB	2.649,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	952,8 kB	4.388,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	842,6 kB	2.473,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.3.1-8+b1	801,9 kB	3.592,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	852,6 kB	3.186,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.3.1-8+b1	854,9 kB	2.866,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.3.1-8+b1	853,5 kB	2.006,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.3.1-8+b1	846,8 kB	2.518,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	977,5 kB	2.355,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	725,3 kB	2.555,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	855,3 kB	2.345,0 kB	[Liste der Dateien]