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Paket: python3-pairtools (0.3.0-2 und andere)

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Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

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i386 0.3.0-2+b2 119,7 kB426,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 0.3.0-2+b2 108,1 kB437,0 kB [Liste der Dateien]
mipsel 0.3.0-2+b2 108,0 kB414,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 0.3.0-2+b2 120,3 kB479,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 0.3.0-2+b2 107,5 kB415,0 kB [Liste der Dateien]