Paket: r-bioc-deseq2 (1.30.1+dfsg-1)

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Externe Ressourcen:

Homepage [bioconductor.org]

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-deseq2

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libblas3

Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: liblapack3

Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

oder liblapack.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 9) [nicht armel, armhf]
dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-api-bioc-3.12

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.0.4-1)

GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
dep: r-bioc-biobase

base functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.7.5)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-genefilter

methods for filtering genes from microarray experiments
dep: r-bioc-geneplotter

R package of functions for plotting genomic data
dep: r-bioc-genomicranges

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
dep: r-bioc-iranges

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18)

BioConductor S4 implementation of vectors and lists
dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.1.6)

BioConductor assay container
dep: r-cran-ggplot2

Implementierung der »Grammar of Graphics«
dep: r-cran-locfit

GNU R local regression, likelihood and density estimation
dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++
dep: r-cran-rcpparmadillo

GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

rec: r-bioc-glmgampoi

GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model
rec: r-bioc-tximport

transcript-level estimates for biological sequencing
rec: r-cran-testthat

GNU R testsuite

sug: r-cran-biocmanager

access the Bioconductor project package repository
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-pbapply

GNU R package providing progress bars for vectorized R functions
sug: r-cran-pheatmap

GNU R package to create pretty heatmaps
sug: r-cran-rcolorbrewer

GNU R package providing suitable color palettes
sug: r-cran-readr

GNU R package to read rectangular text data
sug: r-cran-rmarkdown

Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

r-bioc-deseq2 herunterladen

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.265,5 kB	1.956,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.252,3 kB	1.916,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.256,6 kB	1.930,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.254,2 kB	1.858,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.233,7 kB	1.929,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.255,0 kB	1.970,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	1.258,6 kB	1.966,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.266,2 kB	2.008,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.258,9 kB	1.952,0 kB	[Liste der Dateien]