all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: seqtk  ]

Package: seqtk (1.4-2 and others)

Links for seqtk

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package seqtk:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ

I øjeblikket understøtter seqtk en kvalitetsbaseret justering med algoritmen phred, konvertering fra fastq til fasta, komplementering af omvendte sekvenser, udpakning eller maskering af delsekvender i regioner, der stammer fra en BED/navneliste-fil, og mere. Den indeholder et modul til at indsamle delvise prøver, der indsamler eksakt n sekvenser eller en fraktion af sekvenser.

Seqtk understøtter både inddatafiler af typen fasta og fastq, der valgfrit kan komprimeres med gzip.

Other Packages Related to seqtk

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download seqtk

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 1.4-2 33.8 kB95.0 kB [list of files]
arm64 1.4-2 31.5 kB87.0 kB [list of files]
armel 1.4-2 32.3 kB91.0 kB [list of files]
armhf 1.4-2 32.0 kB71.0 kB [list of files]
i386 1.4-2 37.3 kB103.0 kB [list of files]
mips64el 1.4-2 32.1 kB154.0 kB [list of files]
ppc64el 1.4-2 37.2 kB151.0 kB [list of files]
riscv64 1.4-2+b1 34.7 kB80.0 kB [list of files]
s390x 1.4-2 33.9 kB95.0 kB [list of files]