Package: salmon (1.10.2+ds1-1 and others)

Links for salmon

Debian Resources:

Download Source Package salmon:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Wicked-hurtig transskriptkvantificering fra RNA-seq-data

Salmon er et wicked-hurtigt program til at producere et meget præcist transkriptionsniveau for kvantificeringsestimater fra RNA-seq-data. Salmon opnår nøjagtighed og hastighed via en række forskellige innovationer, herunder brug af simple justeringer (nøjagtige men hurtige til at beregne proxyer til traditionel læsningssammenligninger) og massivt parallelt stokastisk sammenbrudt variationsinferens. Resultatet er et alsidigt værktøj, som passer fint ind i mange forskellige datakanaler. For eksempel kan du vælge at gøre brug af simple justeringer af at give Salmon

 rå sekventeringslæsninger, eller hvis det er mere praktisk kan du give

Salmon regelmæssige sammenligninger (f.eks. beregnet med din favoritsammenligner), og det vil bruge den samme wicked-hurtige og moderne inferensalgoritme til at estimere transkriptionsniveauer for dit eksperiment.

Other Packages Related to salmon

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

Filsystemhandlinger (flytbare stier, iteration over mappere etc.) i C++
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

Bibliotek for Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

bibliotek til programindstillinger for C++
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64]
dep: libjemalloc2 (>= 5.0.0)

skalerbar og samtidig malloc(3)-implementering for mange formål
dep: libjs-sphinxdoc (>= 7.4)

JavaScript-understøttelse for Sphinx-dokumentation
dep: libstaden-read14t64 (>= 1.14.12)

Stadenbibliotek til at læse og skrive DNA-sekvensresultater
dep: libstdc++6 (>= 14)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [arm64]

parallelism library for C++ - runtime files

dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]
dep: libtbbmalloc2 (>= 2017~U7) [amd64]

parallelism helper library for C++ - runtime files

dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.12.0) [arm64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download salmon

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.10.2+ds1-1+b4	3,324.1 kB	12,958.0 kB	[list of files]
arm64	1.10.2+ds1-1+b4	3,087.7 kB	11,366.0 kB	[list of files]