Package: unikmer (0.19.1-1 and others)

Værktøjssæt for nukleinsyre k-mer-analyse

Unikmer er en Golangpakke og et værktøjssæt for nukleinsyre k-mer-analyse, der tilbyder funktioner inklusive set-operation k-mer'er valgfrit med TaxID'er men uden antalsinformation.

K-mer'er er enten kodet (k<=32) eller hashede (arbitrær k) i uint64 og serialiseret i binær fil med endelsen .unik.

TaxID'er kan tildeles når k-mer'er tælles fra genomsekvenser og LCA (Lowest Common Ancestor) er beregnet via set-operationer inklusive beregning af fællesmængde, kryds, set-forskel, unikke og gentagede k-mer'er.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):