all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: seqprep  ]

Package: seqprep (1.3.2-9)

Links for seqprep

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package seqprep:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Strippe adaptere og/eller sammenføjede parrede læsninger af DNA-sekvenser med overlap

SeqPrep er et program til at sammenlægge parrede Illuminalæsninger, der overlapper hinanden ind i en enkelt længere læsning. Det kan også bruges til sin adaptertilpasningsfunktion uden at udføre nogen parrede slut-overlapninger. Når en adaptersekvens er nuværende, det betyder, at de to læsninger skal overlappe (i de fleste tilfælde) så de er kraftigt fusioneret. Når læsninger ikke har adaptersekvens, skal de behandles omhyggeligt, når man laver sammenføjningen, så en langt mere specifik fremgangsmåde er valgt. Standardparametrene blev valgt med tanke på specificitet, så at de kunne køres på biblioteker, hvor meget få læsninger forventes at overlappe hinanden. Det er dog altid sikreste at gemme den overlappende procedure for biblioteker, hvor du har forudgående kendskab til, at en væsentlig del af læsningerne vil have overlapning.

Other Packages Related to seqprep

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download seqprep

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
ppc64el 26.4 kB103.0 kB [list of files]