Package: probalign (1.4-10)

Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder

Probalign bruger estimater, fra partitionsfunktionelle posteriore sandsynligheder, til at beregne den maksimale præcision for multiple sekvensjusteringer. Den yder statistisk set betydeligt bedre end de ledende justeringsprogrammer Probcons v1.1, MAFFT v5.851 og MUSCLE v3.6 i ydelsesmålinger fra BAliBASE 3.0, HOMSTRAD og OXBENCH. Forbedringerne med Probalign er størst på datasæt, der indeholder udvidelser til N/C- terminalen, og på datasæt med sekvenser som er lange sekvenser og har heterogene længder. Med datasæt bestående af heterogene længder, der indeholder gentagelser, er præcisionen for Probalign 10 % og 15 % højere end de andre tre metoder, når standardafvigelse på længden er mindst 300 og 400.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):