Package: dialign-tx (1.0.2-15)

Segmentbaseret flersekvensjustering

DIALIGN-TX er et kommandolinjeværktøj til udførsel af flerjustering af protein- eller DNA-sekvenser. Det er en fuldstændig reimplementering af den segmentbaserede fremgangsmåde inklusiv flere nye forbedringer og heuristik som forbedrer kvaliteten af uddatajusteringer væsentligt sammenlignet med DIALIGN 2.2 og DIALIGN-T. For parvis justering bruger DIALIGN-TX en algoritme til fragmentkædning som favoriserer kæder med lave resultater for lokale justeringer over isolerede fragmenter med høje resultater. For flerjustering bruger DIALIGN-TX en forbedret grådig procedure som er mindre følsom for falske lokale sekvensensheder.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):