Package: dextractor (1.0-6 and others)

(Ud)pakker og kompressionskommandobibliotek

Dextractor-kommandoer gør, at man kan hente præcis og kun den nødvendige information for samling og rekonstruktion fra HDF5-kildefilerne fremstillet af PacBio RS II-sequenceren, eller fra BAM-kildefilerne fremstillet af PacBio Sequel-sequencer.

For hver af de tre udtrukne filtyper - fast, quiva og arrow - indeholder biblioteket kommandoer til at pakke den givne filtype og pakke den ud igen, hvilket er en reversibel proces, der giver den oprindelige ukomprimerede fil. De komprimerede .fasta-filer, med filendelsen .dexta, forbruger 1/4 byte per base. De komprimerede .quiva-filer, med filendelsen .dexqv, forbruger 1.5 byte per base i gennemsnit og de komprimerede .arrow-filer, med filendelsen .dexar, forbruger 1/4 byte per base.

For yderligere information, se venligst den tilgængelige dokumentation på <https://github.com/thegenemyers/DEXTRACTOR>.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):