Package: libfreecontact-dev (1.0.21-14)
Links for libfreecontact-dev
Debian Resources:
Download Source Package freecontact:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
Hurtig protein-kontaktprædiktorbibliotek - udviklingsfiler
FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).
FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.
En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.
Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.
Denne pakke indeholder filer nødvendige for udvikling af programmer med libfreecontact.
Packages providing libfreecontact-dev
- libfreecontact-dev
- Hurtig protein-kontaktprædiktorbibliotek - udviklingsfiler
Other Packages Related to libfreecontact-dev
|
|
|
|
-
- dep: libfreecontact0t64 (= 1.0.21-14)
- Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek
-
- sug: libfreecontact-doc
- Dokumentation for libfreecontact
Download libfreecontact-dev
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armel | 74.7 kB | 298.0 kB | [list of files] |