[ Source: yanosim ]
Package: yanosim (0.1-5 and others)
Links for yanosim
Debian Resources:
Download Source Package yanosim:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Læs simulator nanopore DRS-datasæt
Yanosim har tre indstillinger:
1. Yanosim model:
Opretter en model af forskelle, indsættelser og sletninger baseret på en sammenligning af nanopore DRS-læsninger til en reference. Læsninger bør sammenlignes med et transkriptom d.v.s. uden opdelt sammenligning, via minimap2. De bør have mærket cs2. Yanosim quantify:
Kvantificer antallet af læsninger oversat til hvert transkript i en reference, så det rigtige antal læsninger kan simuleres3. Yanosim simulate:
Givet en model oprettet via yanosim model og per transkript- læste antal oprettet via yanosim simulate, simulerer fejlramte lange-læsninger fra den givne fasta-fil
Other Packages Related to yanosim
|
|
|
|
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-click
- Oprettelsessæt for kommandolinjegrænsefladen - Python 3.x
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-pysam
- Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
-
- dep: python3-scipy
- Videnskabelige værktøjer for Python 3
Download yanosim
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
riscv64 | 0.1-5+b1 | 9.7 kB | 46.0 kB | [list of files] |