all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: yanosim  ]

Package: yanosim (0.1-5 and others)

Links for yanosim

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package yanosim:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Læs simulator nanopore DRS-datasæt

Yanosim har tre indstillinger:

1. Yanosim model:

   Opretter en model af forskelle, indsættelser og sletninger
   baseret på en sammenligning af nanopore DRS-læsninger til en
   reference. Læsninger bør sammenlignes med et transkriptom
   d.v.s. uden opdelt sammenligning, via minimap2. De bør have
   mærket cs
2. Yanosim quantify:
   Kvantificer antallet af læsninger oversat til hvert
   transkript i en reference, så det rigtige antal læsninger
   kan simuleres
3. Yanosim simulate:
   Givet en model oprettet via yanosim model og per transkript-
   læste antal oprettet via yanosim simulate, simulerer fejlramte
   lange-læsninger fra den givne fasta-fil

Other Packages Related to yanosim

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download yanosim

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
riscv64 0.1-5+b1 9.7 kB46.0 kB [list of files]