Package: examl (3.0.22-6)
Links for examl
Debian Resources:
Download Source Package examl:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Exascale Maximum Likelihood-kode (ExaML) for fylogenetisk følgeslutning
Exascale Maximum Likelihood (ExaML) er en kode for fylogenetisk følgeslutning, der bruger MPI. Denne kode implementerer den populære søgealgoritme RAxML for maksimal sandsynlighedsbaseret følgeslutning for fylogenetiske træer.
ExaML er en neddroslet version af RAxML for fylogenetiske følgeslutninger på store datasæt. Programmet kan kun køre nogle meget grundlæggende funktioner og er lavet til computerkyndige brugere, som kan skrive små Perlskripter og har erfaring med at bruge køindsendelsesskripter for klynger. ExaML implementerer kun CAT- og GAMMA-modellerne for satsheterogenitet for binære data, DNA- og proteindata.
ExaML bruger en radikal ny MPI-paralleliseringsfremgangsmåde, som giver forbedret parallel effektivitet, specielt på partitionerede fler-gen eller hel-genom datasæt. Implementerer også en ny algoritme for belastningsudjævning, som giver bedre parallel effektivitet.
Koden er op til fire gange hurtigere end sin forgænger RAxML-Light og skalerer op til et større antal processorer.
Other Packages Related to examl
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 5.0.5)
- Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek
-
- dep: mpi-default-bin
- MPI-kørselstidsprogrammer - metapakke
Download examl
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| riscv64 | 835.5 kB | 1,576.0 kB | [list of files] |