Package: ecopcr (1.0.1+dfsg-5 and others)
Links for ecopcr
Debian Resources:
Download Source Package ecopcr:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [git.metabarcoding.org]
Similar packages:
Estimer PCR-stregkodeprimers kvalitet
DNA-stregkodning er et værktøj til karakterisering af arters oprindelse under anvendelse af en kort sekvens fra en standardposition og indforstået position i arvemassen. Ved at blive brugt som en DNA-stregkode, bør et genom-locus blandt individer af samme art kun variere i mindre grad, og det bør meget hurtigt variere mellem arterne. Fra et praktisk synspunkt skal en stregkode-locus følges af to konserverede områder til at designe PCR-primere. Adskillige manuelt opdagede stregkode-loci ligesom COI, rbcL, 18S, 16S og 23S rDNA eller trnH-ps anvendes rutinemæssigt i dag, men ingen målfunktion er blevet beskrevet til at måle deres kvalitet med hensyn til universalitet (stregkodedækning, Bc) eller i form af taksonomisk kapacitet forskelsbehandling (stregkodespecificitet, Bs).
ecoPCR er et elektronisk PCR-program udviklet af LECA- og Helix-projektet. Det hjælper til med at estimere stregkodeprimeres kvalitet. Sammenholdt med OBITools kan du efterbehandle ecoPCR-resultater til at beregne stregkodedækning og stregkodespecificitet. Nye stregkodeprimere kan udvikles ved hjælp af ecoPrimers-programmer.
Other Packages Related to ecopcr
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-reportlab
- ReportLab-bibliotek til at oprette PDF-dokumenter der bruger Python 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download ecopcr
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-5 | 57.0 kB | 356.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 1.0.1+dfsg-5 | 57.2 kB | 240.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1.0.1+dfsg-5+b1 | 55.9 kB | 357.0 kB | [list of files] |
| armel | 1.0.1+dfsg-5 | 53.4 kB | 208.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1.0.1+dfsg-5 | 51.6 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-5 | 57.4 kB | 216.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1.0.1+dfsg-5 | 57.5 kB | 240.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-4 | 70.1 kB | 332.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-5 | 52.5 kB | 216.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1.0.1+dfsg-5 | 56.0 kB | 365.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-5 | 59.0 kB | 420.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1.0.1+dfsg-5 | 60.0 kB | 356.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1.0.1+dfsg-5 | 57.4 kB | 212.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1.0.1+dfsg-5 | 57.2 kB | 240.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-5 | 58.0 kB | 354.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-5 | 54.1 kB | 4,199.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 1.0.1+dfsg-5 | 56.8 kB | 236.0 kB | [list of files] |