Package: libtfbs-perl (0.7.1+ds-4 and others)

Links for libtfbs-perl

Debian Resources:

Download Source Package libtfbs-perl:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [tfbs.genereg.net]

Similar packages:

Skanning af en DNA-sekvens med en positionsvægtet matrix

Perlmodulet TFBS betår af et sæt af rutiner til interaktion med Transfac- og Jaspar-databaser, der beskriver en speciel proteinfamilie, transkriptionsfaktorerne. Disse binder sig til genom-DNA for at igangsætte (eller forhindre) udlæsningen af et gen. Når flere bindingssteder er kendt for en transkriptionsfaktor, så samles disse i en enkelt fil og sammenlignes for at finde for positionen specifikke karakteristika, der kan bruges til at forudse sådanne bindingshændelser i nye DNA-sekvenser.

Hvis du bruger TFBS i dit arbejde, så citer venligst »Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136«.

Bemærk: Perlmodulet TFBS er ikke længere under aktiv udvikling. Al funktionalitet kan findes i pakken TFBSTools Bioconductor; brugere anbefales at skifte. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Role: Development Library, Program

Other Packages Related to libtfbs-perl

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bioperl

Perlværktøjer til modellering af molekylær biologi
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libdbi-perl

databasegrænseflade til Perl (DBI)
dep: libwww-perl

Simpel og konsistent grænseflade til World Wide Web
dep: pdl (>= 1:2.093-1+b1)

Perl-datasprog: Perludvidelser for numeriske tal
dep: pdlapi-20

virtual package provided by pdl
dep: perl (>= 5.40.0-6)

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: perlapi-5.40.0

virtual package provided by perl-base

rec: libgd-gd2-perl

virtual package provided by libgd-perl

or libgd-gd2-noxpm-perl

virtual package provided by libgd-perl

Download libtfbs-perl

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.7.1+ds-4+b1	216.4 kB	981.0 kB	[list of files]