Package: sumtrees (4.4.0-1)

Fylogenetisk træsummering og annotation

SumTrees er et program til at summere ikkeparametrisk boostrap eller Bayesiansk posterior understøttelse af sandsynlighed for opdelinger eller clader på fylogenetiske træer.

Grundlaget for støttebedømmelsen er typisk givet af et sæt af ikkeparametriske bootstrap-replikerede træprøver produceret af programmer såsom GARLI eller RAxML, eller ved et sæt MCMC-træprøver produceret af programmer som Mr. Bayes eller BEAST. Andelen af træer ud af prøverne, hvor en bestemt deling er fundet, anses for at være graden af støtte til den splittelse, som er angivet af prøverne. De prøver, som er grundlaget for støtten kan fordeles på tværs af flere filer og en indbrændingsindstilling giver mulighed for at et antal træer i hver fil udelukkes fra analysen, hvis de ikke anses for at være trukket fra den korrekte supportdistribution.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):