Package: sumatra (1.0.31-2)

Hurtig og præcis sammenligning og sekvensklynger

Med udviklingen af den næste generation af sekventering skal effektive værktøjer håndterer millioner af sekvenser på en fornuftig tid. Sumatra er et program udviklet af LECA. Sumatra forsøger at sammenligne sekvenser på en måde som er hurtig og præcis på samme tid. Dette værktøj er blevet udviklet som en tilpasning til den type af data som oprettes af DNA-metastregkodere, dvs. fuldt ud sekventeret, korte markører. Sumatra beregner de parvis sammenligningsbedømmelser fra et datasæt eller mellem to datasæt, med mulighed for at angive en lighedstærskel hvorefter sekvenspar som har en lavere lighed ikke rapporteres. Uddata kan gå igennem en klassifikationsproces med programmer såsom MCL eller MOTHUR.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):