[ Source: python-pyfaidx ]
Package: python-pyfaidx-examples (0.5.5.2-1)
Links for python-pyfaidx-examples
Debian Resources:
Download Source Package python-pyfaidx:
- [python-pyfaidx_0.5.5.2-1.dsc]
- [python-pyfaidx_0.5.5.2.orig.tar.gz]
- [python-pyfaidx_0.5.5.2-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Dataeksempel for effektiv vilkårlig adgang til fasta-undersekvenser for Python
Samtools tilbyder en funktion »faidx« (FAsta InDeX), der opretter en lille flad indeksfil ».fai« der tillader hurtig vilkårlig adgang til enhver undersekvens i den indekserede FASTA-fil, mens der indlæses en minimal mængde af filen i hukommelsen. Dette Pythonmodul implementerer rene Pythonklasser for indeksering, indhentelse og på stedet ændring af FASTA-filer via et samtools-kompatibelt indeks. Modulet pyfaidx er API-kompatibelt med pygr seqdb-modulet. Et kommandolinjeskript »faidx« er installeret sammen med modulet pyfaidx og faciliterer kompleks manipulering af FAST-filer uden nogen programmeringsviden.
Denne pakke tilbyder eksempler på data til at teste Pythonmodulerne.
Other Packages Related to python-pyfaidx-examples
|
|
|
|
-
- sug: python3-pyfaidx
- Effektiv vilkårlig adgang til fasta-undersekvenser for Python 3
- or python-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python
Download python-pyfaidx-examples
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 46.1 kB | 66.0 kB | [list of files] |