all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: fitgcp  ]

Package: fitgcp (0.0.20150429-2)

Links for fitgcp

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package fitgcp:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Tilpasning af arvemasse-dækningsdistributioner med blandingsmodeller

Arvemassedækning, antallet af sekventeringslæsninger oversat til en position i et genom, er en indsigtsfuld indikator for uregelmæssigheder i sekventeringsforsøg. Mens den gennemsnitlige genomdækning ofte anvendes inden for algoritmer i beregningsmæssig genomik, er de fuldstændige oplysninger til rådighed i dækningsprofiler (d.v.s. histogrammer over alle dækningsområder) i øjeblikket ikke udnyttet fuldt ud. Bias såsom fragmenteret eller fejlagtigt henviste genomer bliver derfor ikke indregnet. At gøre denne oplysning tilgængelig kan forbedre kvaliteten af sekventeringseksperimenter og kvantitative analyser.

fitGCP er en ramme for montering af blandinger af sandsynlighedsfordelinger for genom-dækningsprofiler. Udover almindeligt anvendte distributioner, bruger fitGCP distributioner skræddersyet til at redegøre for de fælles artefakter. Blandingsmodeller er iterativt tilpasset baseret på Expectation-Maximization-algoritmen.

Other Packages Related to fitgcp

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download fitgcp

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 12.2 kB50.0 kB [list of files]