Package: vg-docs (1.30.0+ds-1)

Værktøjer til arbejdet med genomvariationsgrafer - dok.

Datastrukturer for variationsgrafer, interchange-formater, sammenligning, genotyper og variantkaldemetoder.

Variationsgrafer tilbyder en kortfattet kodning af sekvenserne for mange genomer. En variationsgraf (specielt som implementeret i vg) består af:

 - knuder, der navngives efter sekvenser og id'er
 - kanter, der forbinde to knuder via en af deres respektive endelser
 - stier, beskriv genomer, sekvenssammenligninger og kommentarer (såsom
   genmodeller og transkripter) som gennemløb via knuder forbundet via
   kanter

Denne model svarer til et antal af sekvensgrafer, der er blevet brugt i samling af og flere sekvenssammenligninger. Stier tilbyder koordinatsystemer relativt til genomer kodet i grafen, hvilket gør at stabile oversættelser fremstilles selv hvis strukturen for grafen er ændret.

Denne pakke indeholder dokumentationen.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):