Package: umis (1.0.7-1 and others)

Links for umis

Debian Resources:

Download Source Package umis:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Værktøjer til at behandle UMI RNA-mærkedata

Umis tilbyder værktøjer til at estimere udtryk i RNA-Seq-data, der udfører sekventering af slutmærker for transkript og indarbejde molekylære mærker til at rette amplifikationsbias.

Der er fire trin i denne proces.

 1. Formatering af læsninger
 2. Filtrering af cellulære stregkoder ramt af støj
 3. Pseudooversættelse til cDNA'er
 4. Tælle molekylære identifikatorer

Other Packages Related to umis

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.4) [not arm64, ppc64el]
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-click

Omslag omkring optparse for kommandolinjeredskaber - Python 3.x
dep: python3-pandas

Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
dep: python3-pysam

Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
dep: python3-regex

Alternativt regulært udtryksmodul - Python 3
dep: python3-scipy

Videnskabelige værktøjer for Python 3
dep: python3-toolz

List processing tools and functional utilities

sug: umis-examples

Værktøjer til at behandle UMI RNA-mærkedata - eksempler

Download umis

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.7-1+b1	25.2 kB	114.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.7-1+b1	24.8 kB	110.0 kB	[list of files]
armel	1.0.7-1+b1	25.7 kB	109.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.7-1+b1	24.3 kB	105.0 kB	[list of files]
i386	1.0.7-1+b1	25.7 kB	109.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.7-1+b1	25.1 kB	111.0 kB	[list of files]
mipsel	1.0.7-1+b1	25.0 kB	110.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.7-1+b1	25.6 kB	158.0 kB	[list of files]