[ Source: pizzly ]
Package: pizzly (0.37.3+ds-5)
Links for pizzly
Debian Resources:
Download Source Package pizzly:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Identificerer genfusioner i RNA-sekventeringsdata
Til fortolkningen af transkriptomet (overfloden og sekvens af RNA) af kræftceller er man især interesseret i transskriptioner, der ikke kan kortlægges til enkeltstående gener, men som ses at være fusioneret som dele fra to gener. Sandsynlige forklaringer er kromosomale translokationer.
Pizzly kan identificere nye sådanne særheder ved at bygge videre på fortolkninger af variabel splejsning med værktøjet kallisto. Begge værktøjer er elementer i bcbio-arbejdsgangen.
Other Packages Related to pizzly
|
|
|
|
-
- dep: kallisto
- Næsten optimal RNA-Seq-kvantificering
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [not armel]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.30) [armel]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libstdc++6 (>= 10.2) [armel]
- GNU Standard C++ bibliotek v3
- dep: libstdc++6 (>= 7) [armhf]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- rec: python3-h5py
- Almene Pythongrænseflader til hdf5
Download pizzly
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 287.4 kB | 876.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 251.7 kB | 808.0 kB | [list of files] |
| armel | 240.5 kB | 763.0 kB | [list of files] |
| armhf | 251.0 kB | 591.0 kB | [list of files] |
| i386 | 296.3 kB | 883.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 245.9 kB | 962.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 250.7 kB | 940.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 282.7 kB | 988.0 kB | [list of files] |
| s390x | 249.6 kB | 876.0 kB | [list of files] |